債券利差的第三個重要組成部分是稅收補償。一般來說，投資信用債券所取得的利息是要納稅的，稅收補償而投資國債的收益卻不必納稅，因此投資者投資信用債券需要更高的收益以補償稅收支出。這部分用于彌補稅收支出的收益率就是稅收對利差的解釋部分。如在美國各州的公司債券納稅范圍大致在5%～10%之間。稅收補償Elton（2001）發現，差別稅收比預期違約損失對價差具有更重要的影響，因為稅收占企業債和國債之間差異的更大部分，他根據平均稅率4.875%進行實證研究，稅收補償發現稅收因素大致可以解釋利差的28%～73%。

在中國，國債利息免征個人所得稅，而信用債券利息需征收個人所得稅（除了部分免稅的企業債券外），即個人投資者無論是在一級發行市場還是在二級市場購買企業債券，稅收補償持有到期后取得的利息收入均應繳納20%的個人所得稅，稅款由兌付利息的機構代扣代繳。因此，征收的利息所得稅直接構成了信用價差的組成因素之一。但是，稅收補償機構投資者只需要按其利潤繳納所得稅，不需要繳納利息稅，個人投資者可以通過在付息前交易來避稅，因此本文中暫不考慮利息稅對利差的影響。