雖然《企業債券管理條例》（國務院令〔1993〕第121號）對發行債券的企業沒有具體要求，但是由于企業債券結構發債需要經過審批，國家發改委為了防范債券風險，債券結構對企業發行債券控制比較嚴格，只有符合一定條件的企業才能發行債券，這使得中國的企業債券市場結構嚴重失調。

從2002～2009年中國企業債存量數據來看，中央企業和地方城投公司發債數量平均占到84.3%，其中2003年高達96.3%。如果單單考慮地方企業債券，債券結構結構失調尤為嚴重。剔除中央企業債券后，城投債占地方企業發行債券總量的比例將近60%。從發展趨勢來看，2002～2007年，除了2003年之外，城投債占地方債券的比例一直保持在40%左右。而2007年以后，城投債占地方債券比例迅速上升，2009年則超過了2/3。

此外，從債券期限來看，中國的城投債期限結構也不太合理，較為單一。中國城投債期限主要集中于7年和10年，10年期以上的債券比重較小，7年期以下的債券也占到總數的20%。然而城投債由于其特定用途，投資項目的期限多數較長，短期內很難產生經濟效應，這就使得債券短期內無法通過項目收益來償還本息，造成了短期內償債壓力較大。總之，債券比例的嚴重失調，債券結構會嚴重影響地方經濟的發展，進而影響地方政府的財政收入和城投債的健康發展。此外，地方政府借用企業債券形式發行的城投債，不僅會對生產性企業產生“擠出效應”，阻礙企業債券的發展，而且債券結構這種企業債券一般期限較短，難以達到市政債券長期融資的效果。